16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0441 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0441  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  348  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.346927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0995  hypothetical protein  52.75 
 
 
182 aa  186  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.606153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1290  hypothetical protein  51.5 
 
 
184 aa  170  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1211  hypothetical protein  46.11 
 
 
177 aa  155  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0202037  normal  0.640858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0663  hypothetical protein  49.06 
 
 
157 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0064  hypothetical protein  46.63 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0046  hypothetical protein  47.44 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0823  hypothetical protein  38.89 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.324889  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0989  hypothetical protein  37.04 
 
 
161 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00450031  hitchhiker  0.000444366 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3676  hypothetical protein  26.92 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0958587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0441  hypothetical protein  29.63 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0534  hypothetical protein  29.87 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.721836  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1267  hypothetical protein  34.38 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.793977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2216  hypothetical protein  31.65 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1024  hypothetical protein  28.21 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1842  hypothetical protein  32.14 
 
 
100 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0603904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>