24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1901 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1901    100 
 
 		 797 bp  1580    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0547167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1761    94.19 
 
 		 1008 bp  1172    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2339  transposase, IS4 family protein  92.44 
 
 		 1170 bp  1053    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1836  transposase, IS4 family protein  92.44 
 
 		 1170 bp  1053    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0871    84.36 
 
 		 725 bp  212  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  84.85 
 
 		 1170 bp  198  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0350  transposase IS4 family protein  82.64 
 
 		 1149 bp  151  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0072    84.08 
 
 		 1156 bp  137  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.319917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0869    87.1 
 
 		 207 bp  119  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0138  transposase, IS4 family protein  88.42 
 
 		 225 bp  101  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3183  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3447  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3567  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3141  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3134    100 
 
 		 11659 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3039  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331814  normal  0.984797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    100 
 
 		 4766 bp  48.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0938    100 
 
 		 2917 bp  48.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2507  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2386  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2093  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1683  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000475694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1315  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>