29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0072 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0072    100 
 
 		 1156 bp  2292    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.319917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  95.04 
 
 		 1170 bp  1867    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2339  transposase, IS4 family protein  83.36 
 
 		 1170 bp  444  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1836  transposase, IS4 family protein  83.36 
 
 		 1170 bp  444  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1761    80.81 
 
 		 1008 bp  234  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0138  transposase, IS4 family protein  92.12 
 
 		 225 bp  224  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2372  hypothetical protein  96.55 
 
 		 162 bp  198  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1901    84.08 
 
 		 797 bp  137  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0547167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1289  transposase, IS4 family protein  83.15 
 
 		 237 bp  119  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0350  transposase IS4 family protein  82.47 
 
 		 1149 bp  115  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0873    83.08 
 
 		 186 bp  83.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0871    86.75 
 
 		 725 bp  77.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0869    85.71 
 
 		 207 bp  71.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0609    93.94 
 
 		 546 bp  50.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2974  transposase IS4 family protein  93.94 
 
 		 939 bp  50.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2646  transposase IS4 family protein  93.94 
 
 		 1119 bp  50.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2064    93.94 
 
 		 1110 bp  50.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3447  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3183  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3141  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3134    100 
 
 		 11659 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3567  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3039  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331814  normal  0.984797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2507  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2386  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2093  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1683  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000475694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1315  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  48.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>