19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0138 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0138  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
74 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.466796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2339  transposase, IS4 family protein  82.19 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1836  transposase, IS4 family protein  82.19 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  80.82 
 
 
389 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0350  transposase IS4 family protein  76.19 
 
 
382 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  53.52 
 
 
389 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3183  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3447  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2223  transposase IS4  50 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.285308  normal  0.571436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3141  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3039  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331814  normal  0.984797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2507  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2386  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000599184  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2093  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1683  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000475694  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1315  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3567  transposase IS4  47.89 
 
 
389 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  52.63 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  51.39 
 
 
389 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>