23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3134 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  89.42 
 
 		 1170 bp  1287    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3567  transposase IS4  99.83 
 
 		 1170 bp  2303    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1315  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  2319    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1683  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  2319    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000475694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2093  transposase IS4  99.83 
 
 		 1170 bp  2303    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2386  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  2319    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2507  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  2319    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3039  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  2319    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331814  normal  0.984797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3134    100 
 
 		 11659 bp  23110    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3135  hypothetical protein  100 
 
 		 540 bp  1070    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0018929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3141  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  2319    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3183  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  2319    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3447  transposase IS4  100 
 
 		 1170 bp  2319    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3137  hypothetical protein  100 
 
 		 285 bp  565  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  86.38 
 
 		 690 bp  424  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1497    79.15 
 
 		 2038 bp  155  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  85.37 
 
 		 693 bp  101  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  86.52 
 
 		 687 bp  81.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  94.74 
 
 		 747 bp  60  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  90 
 
 		 690 bp  60  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  88.89 
 
 		 1170 bp  60  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2223  transposase IS4  87.1 
 
 		 1170 bp  60  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.285308  normal  0.571436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  87.72 
 
 		 1170 bp  58  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>