13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0644 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0644  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 
46 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000438931  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  76.92 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.33 
 
 
189 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  58 
 
 
189 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  54 
 
 
188 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  58 
 
 
189 aa  50.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  50 
 
 
189 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  51.02 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.38 
 
 
194 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  47.92 
 
 
188 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.08 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  45.1 
 
 
190 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.18 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>