168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3639 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3639  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 61 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000267113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1073  50S ribosomal protein L28  61.4 
 
 		 62 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000450707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1045  ribosomal protein L28  59.65 
 
 		 62 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000342446  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1262  50S ribosomal protein L28  56.14 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000202821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1277  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.726545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1167  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422025  unclonable  0.0000000208051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2153  50S ribosomal protein L28  49.18 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.757041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09970  LSU ribosomal protein L28P  51.72 
 
 		 62 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  hitchhiker  0.00000165787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0606  ribosomal protein L28  46.38 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000986051  normal  0.618887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8027  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4214  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1024  ribosomal protein L28  46.43 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2112  50S ribosomal protein L28  47.27 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239307  normal  0.0348844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3523  ribosomal protein L28  44.93 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.877625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11200  LSU ribosomal protein L28P  45 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00741345  normal  0.589072 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1027  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.807018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0610  ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.904571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2281  ribosomal protein L28  45 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.921868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1934  50S ribosomal protein L28  48.21 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2306  ribosomal protein L28  43.64 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000277359  hitchhiker  0.00207431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1980  50S ribosomal protein L28  48.21 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1914  50S ribosomal protein L28  48.21 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.244589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12990  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.400597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3274  ribosomal protein L28  46.3 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0370278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1846  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  45.28 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1653  ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2199  ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000434288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  43.1 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1582  50S ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.169175  normal  0.0677157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1367  50S ribosomal protein L28  45 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.23268  normal  0.35924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1351  ribosomal protein L28  49.06 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000031136  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  43.4 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  43.4 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1676  ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000538501  hitchhiker  0.00422618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  46.43 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1599  ribosomal protein L28  45 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05560  LSU ribosomal protein L28P  44.23 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0290  ribosomal protein L28  49.12 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10800  LSU ribosomal protein L28P  48.28 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.53049  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3659  ribosomal protein L28  49.12 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3202  ribosomal protein L28  45.45 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4037  ribosomal protein L28  50 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5979  ribosomal protein L28  43.64 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1279  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0423459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1870  50S ribosomal protein L28  45.45 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.252757  hitchhiker  0.00588786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  47.27 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1833  ribosomal protein L28  42.59 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000322971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0627  50S ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00471545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0071  ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2835  ribosomal protein L28  43.64 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00627595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  43.4 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1744  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000205787  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09220  LSU ribosomal protein L28P  43.64 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0555993  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2425  50S ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00488373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2750  50S ribosomal protein L28  41.82 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2397  50S ribosomal protein L28  43.4 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222806  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0693  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1343  LSU ribosomal protein L28P  45.28 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.754318  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3439  ribosomal protein L28  43.1 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  41.07 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3105  50S ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00824796 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3856  ribosomal protein L28  37.29 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000509188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0072  ribosomal protein L28  37.93 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2326  50S ribosomal protein L28  41.82 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.972077  normal  0.129991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0206  ribosomal protein L28  50 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8002  LSU ribosomal protein L28P  46.55 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  38.98 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3291  ribosomal protein L28  37.29 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36500  LSU ribosomal protein L28P  38.98 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.608 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  32.73 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  39.62 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19190  50S ribosomal protein L28  51.28 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.182224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1131  50S ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3608  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3287  50S ribosomal protein L28P  38.33 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0886721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0601  ribosomal protein L28  33.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000015913  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1088  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0368802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1312  ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1508  50S ribosomal protein L28  41.51 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0391  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  44.83 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1978  ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3904  ribosomal protein L28  35.29 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000260959  normal  0.15188 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0991  ribosomal protein L28  37.74 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000939773  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  35.19 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0222  50S ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3372  50S ribosomal protein L28  32.76 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4518  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1468  ribosomal protein L28  32.2 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0287  ribosomal protein L28  35.59 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123912  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0607  ribosomal protein L28  38.6 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0159  ribosomal protein L28  38.6 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0670  ribosomal protein L28  33.96 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000425645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>