More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0610 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0610  ribosomal protein L28  100 
 
 		 83 aa  168  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.904571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3372  50S ribosomal protein L28  56.25 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3087  ribosomal protein L28  52.86 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280967  normal  0.0287054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1282  50S ribosomal protein L28  52.86 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0607  ribosomal protein L28  52.7 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0021  ribosomal protein L28  52.86 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3428  50S ribosomal protein L28  51.43 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0550772  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3149  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.65679 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1757  50S ribosomal protein L28  51.43 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.991694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0055  ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378886  normal  0.0544728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2903  ribosomal protein L28  53.85 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.961047  normal  0.643497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2445  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2139  ribosomal protein L28  51.47 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.476497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3180  50S ribosomal protein L28  50.67 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3802  50S ribosomal protein L28  49.33 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2855  ribosomal protein L28  53.85 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.621933  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2589  50S ribosomal protein L28  51.43 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.155889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2713  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2323  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1468  ribosomal protein L28  46.67 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255813  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1918  ribosomal protein L28  48 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3679  50S ribosomal protein L28  48 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185253  normal  0.0401063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0312  50S ribosomal protein L28  47.14 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000118312  normal  0.224841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1117  50S ribosomal protein L28  47.14 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1452  50S ribosomal protein L28  48 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2420  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127484  hitchhiker  0.000900978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2231  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0584  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1137  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5834  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.685508 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0983  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0780  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0978  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1021  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0793  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1891  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2549  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2502  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.553249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2527  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0191  50S ribosomal protein L28  48 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000089275  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00055  ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000288614  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2647  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753369  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2733  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0753  50S ribosomal protein L28  47.14 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2870  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0696096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2100  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.295795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1253  50S ribosomal protein L28  46.15 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5282  50S ribosomal protein L28  44.29 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5537  50S ribosomal protein L28  45.59 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0793752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0188  50S ribosomal protein L28  45.33 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1734  50S ribosomal protein L28  45.71 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4374  50S ribosomal protein L28  45.33 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.335186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5192  50S ribosomal protein L28  44.29 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244386  normal  0.27276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2971  50S ribosomal protein L28  45.71 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48050  50S ribosomal protein L28  45.33 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0048  ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.635259  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19190  50S ribosomal protein L28  45.71 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.182224  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5333  50S ribosomal protein L28  44.29 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220339 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70190  50S ribosomal protein L28  44.29 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2599  50S ribosomal protein L28  48 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6092  50S ribosomal protein L28  44.29 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00654  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0395  50S ribosomal protein L28  43.24 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.249784  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0544  50S ribosomal protein L28  46.48 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0520  50S ribosomal protein L28  46.48 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1790  50S ribosomal protein L28  43.24 
 
 		 79 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.588702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001820  LSU ribosomal protein L28p  48.57 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2641  50S ribosomal protein L28P  44.29 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3856  ribosomal protein L28  51.56 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000509188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3521  ribosomal protein L28  42.65 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0570  hypothetical protein  38.57 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0629  50S ribosomal protein L28  47.14 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000303775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1995  ribosomal protein L28  45.71 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3827  50S ribosomal protein L28  45.33 
 
 		 78 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.199336  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0089  ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0224  50S ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0327  ribosomal protein L28  45.33 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0383291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3565  50S ribosomal protein L28  45.71 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0150151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0325  ribosomal protein L28  45.71 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0601  ribosomal protein L28  44.58 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000015913  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2640  ribosomal protein L28  45.71 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2021  ribosomal protein L28  44.29 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0159  ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0601  50S ribosomal protein L28  46.03 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.201453  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3921  50S ribosomal protein L28  42.31 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0589  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.74438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3291  ribosomal protein L28  44.29 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0389  50S ribosomal protein L28  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000230782  hitchhiker  0.0000579861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4247  50S ribosomal protein L28  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  46.67 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0377  50S ribosomal protein L28  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3769  50S ribosomal protein L28  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326629  normal  0.774565 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0378  50S ribosomal protein L28  44 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000507603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>