63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1653 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1653  ribosomal protein L28  100 
 
 		 73 aa  153  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3523  ribosomal protein L28  59.38 
 
 		 68 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.877625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0606  ribosomal protein L28  57.81 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00000986051  normal  0.618887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0601  ribosomal protein L28  50 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000015913  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3904  ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000260959  normal  0.15188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3639  50S ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000267113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1073  50S ribosomal protein L28  36.76 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000450707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1045  ribosomal protein L28  36.76 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000342446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1262  50S ribosomal protein L28  35.29 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000202821  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09970  LSU ribosomal protein L28P  41.67 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  hitchhiker  0.00000165787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1279  50S ribosomal protein L28  36.51 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0423459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2199  ribosomal protein L28  39.68 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000434288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0670  ribosomal protein L28  35.94 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000425645  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0863  ribosomal protein L28  38.33 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  normal  0.761868 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1024  ribosomal protein L28  36.51 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1367  50S ribosomal protein L28  34.43 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.23268  normal  0.35924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4672  ribosomal protein L28  34.43 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1088  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0368802  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11200  LSU ribosomal protein L28P  36.07 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00741345  normal  0.589072 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  33.33 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2306  ribosomal protein L28  34.43 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000277359  hitchhiker  0.00207431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1744  50S ribosomal protein L28  30.16 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000205787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  35.94 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0071  ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05560  LSU ribosomal protein L28P  40 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  35 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1351  ribosomal protein L28  36.67 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000031136  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0072  ribosomal protein L28  31.15 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0514573  hitchhiker  0.000000000000135012 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1676  ribosomal protein L28  34.43 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000538501  hitchhiker  0.00422618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2281  ribosomal protein L28  34.43 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.921868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  32.81 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1508  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  32.81 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  35 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2893  ribosomal protein L28  30.65 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3439  ribosomal protein L28  32.2 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1027  50S ribosomal protein L28  33.87 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.807018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0627  50S ribosomal protein L28  31.15 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00471545  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1599  ribosomal protein L28  31.15 
 
 		 63 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  31.15 
 
 		 63 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  31.75 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3105  50S ribosomal protein L28  39.39 
 
 		 69 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00824796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1846  50S ribosomal protein L28  39.39 
 
 		 69 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0315  ribosomal protein L28  31.15 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0997058 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0821  ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8027  50S ribosomal protein L28  31.15 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  32.26 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0290  ribosomal protein L28  34.29 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0693  50S ribosomal protein L28  32.26 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  31.67 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3659  ribosomal protein L28  31.34 
 
 		 87 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1987  50S ribosomal protein L28  32.79 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  32.81 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1343  LSU ribosomal protein L28P  30.51 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.754318  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3287  50S ribosomal protein L28P  34.43 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0886721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2153  50S ribosomal protein L28  31.75 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.757041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4214  50S ribosomal protein L28  31.75 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>