297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0287 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0287  ribosomal protein L28  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123912  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3291  ribosomal protein L28  69.23 
 
 		 78 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19190  50S ribosomal protein L28  67.95 
 
 		 78 aa  117  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.182224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3723  50S ribosomal protein L28  67.95 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3921  50S ribosomal protein L28  67.95 
 
 		 78 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1468  ribosomal protein L28  64.1 
 
 		 78 aa  113  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0607  ribosomal protein L28  65.38 
 
 		 79 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3856  ribosomal protein L28  66.22 
 
 		 78 aa  106  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000509188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36500  LSU ribosomal protein L28P  64.1 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0159  ribosomal protein L28  59.74 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5489  50S ribosomal protein L28  61.54 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234709  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1312  ribosomal protein L28  66.67 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3372  50S ribosomal protein L28  56.41 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6092  50S ribosomal protein L28  56.41 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70190  50S ribosomal protein L28  56.41 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2855  ribosomal protein L28  57.69 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.621933  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2021  ribosomal protein L28  57.14 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2903  ribosomal protein L28  58.97 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.961047  normal  0.643497 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2314  ribosomal protein L28  54.55 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.959649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2733  50S ribosomal protein L28  53.95 
 
 		 77 aa  87.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5116  50S ribosomal protein L28  60.26 
 
 		 78 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.478669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4731  50S ribosomal protein L28  60.26 
 
 		 78 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4817  50S ribosomal protein L28  60.26 
 
 		 78 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0450945  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2870  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0696096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1918  ribosomal protein L28  53.25 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0188  50S ribosomal protein L28  52.56 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2445  50S ribosomal protein L28  51.32 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  51.28 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2670  50S ribosomal protein L28  51.28 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2323  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837544 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2231  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2713  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2527  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1137  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2420  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127484  hitchhiker  0.000900978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5834  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.685508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0584  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0780  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1021  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0978  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0983  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0589  50S ribosomal protein L28  50.65 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.74438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1891  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2549  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2502  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.553249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0793  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  51.32 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1995  ribosomal protein L28  50.65 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0325  ribosomal protein L28  48.05 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2100  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.295795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4374  50S ribosomal protein L28  51.95 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.335186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48050  50S ribosomal protein L28  51.95 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2647  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3959  50S ribosomal protein L28  51.28 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3149  50S ribosomal protein L28  51.32 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.65679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0160  50S ribosomal protein L28  51.28 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3565  50S ribosomal protein L28  51.95 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0150151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2640  ribosomal protein L28  47.44 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  51.32 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4099  50S ribosomal protein L28  51.28 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0864217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4389  50S ribosomal protein L28  51.28 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00781562  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1734  50S ribosomal protein L28  46.05 
 
 		 77 aa  80.1  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0055  ribosomal protein L28  48.05 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378886  normal  0.0544728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4841  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000224524  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0629  50S ribosomal protein L28  50.65 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000303775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2589  50S ribosomal protein L28  51.32 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.155889 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2641  50S ribosomal protein L28P  49.35 
 
 		 78 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03494  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0068  ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4115  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4008  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1253  50S ribosomal protein L28  46.15 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4054  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03446  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00212142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3927  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0253871  hitchhiker  0.00124431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5007  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000024574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0312  50S ribosomal protein L28  44.87 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000118312  normal  0.224841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3802  50S ribosomal protein L28  46.05 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3846  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.05688e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3945  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00834113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3972  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000229702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4138  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4062  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000394805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0074  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000990162  hitchhiker  0.000000134659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  48.68 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4154  50S ribosomal protein L28  48.72 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0056  50S ribosomal protein L28  48.72 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000196759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2971  50S ribosomal protein L28  49.35 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458218  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0062  50S ribosomal protein L28  48.72 
 
 		 78 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  48.68 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  47.37 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4559  ribosomal protein L28  47.44 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0102  50S ribosomal protein L28  48.72 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000949516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  47.37 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12095  50S ribosomal protein L28  56.41 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000776276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1452  50S ribosomal protein L28  44.74 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00055  ribosomal protein L28  48.72 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000288614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3428  50S ribosomal protein L28  48.68 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0550772  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  49.35 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3679  50S ribosomal protein L28  46.75 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185253  normal  0.0401063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>