14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04540 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF04540  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10182  eukaryotic translation initiation factor 3 subunit EifCf, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09330)  34.31 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.387432 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11458  COP9 SigNalosome subunit 6  30.18 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72792  predicted protein  27.61 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.624478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86356  predicted protein  24.32 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41064  predicted protein  26.1 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.854437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17259  regulatory proteasome non-atpase subunit 8  23.99 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000381364  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05121  hypothetical protein similar to proteasome regulatory subunit 8 RPN8 (Eurofung)  32.03 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46961  predicted protein  29.08 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00350  proteasome regulatory subunit 12, putative  23.86 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03400  COP9 complex subunit 6, putative  25.82 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04492  proteasome regulatory particle subunit (RpnK), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03400)  32.5 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0684928  normal  0.0283243 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35481  predicted protein  31.08 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686481  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02100  multidrug resistance protein, putative  31.46 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>