21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04470 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC04470  delta24(24-1) sterol reductase, putative  100 
 
 
490 aa  1025    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322028  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1354  putative delta(24(24(1)))-sterol reductase  48.1 
 
 
448 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1293  delta(24(24(1)))-sterol reductase  48.1 
 
 
459 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10648  sterol reductase (Eurofung)  40.5 
 
 
567 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29811  predicted protein  43.64 
 
 
479 aa  372  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02684  sterol reductase (Eurofung)  42.58 
 
 
488 aa  343  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49215  predicted protein  31.22 
 
 
461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.39861 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48260  predicted protein  32.28 
 
 
467 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01070  C-14 sterol reductase, putative  29.71 
 
 
459 aa  177  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36016  predicted protein  29.35 
 
 
443 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.873623  hitchhiker  0.00561321 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04094  c-14 sterol reductase (AFU_orthologue; AFUA_1G03150)  26.67 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1256  sterol delta-7-reductase  26.28 
 
 
455 aa  99  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000127228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1309  putative 7-dehydrocholesterol reductase  26.28 
 
 
455 aa  98.2  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000135156  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30461  predicted protein  23.11 
 
 
463 aa  90.1  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.89 
 
 
217 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.78 
 
 
219 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.67 
 
 
219 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.44 
 
 
219 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.44 
 
 
219 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.33 
 
 
219 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  25.56 
 
 
219 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>