15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48260 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48260  predicted protein  100 
 
 
467 aa  960    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49215  predicted protein  45.51 
 
 
461 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.39861 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36016  predicted protein  43.24 
 
 
443 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.873623  hitchhiker  0.00561321 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01070  C-14 sterol reductase, putative  45.19 
 
 
459 aa  291  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04094  c-14 sterol reductase (AFU_orthologue; AFUA_1G03150)  38.94 
 
 
496 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1354  putative delta(24(24(1)))-sterol reductase  32.98 
 
 
448 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1293  delta(24(24(1)))-sterol reductase  32.98 
 
 
459 aa  203  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04470  delta24(24-1) sterol reductase, putative  30.36 
 
 
490 aa  192  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322028  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10648  sterol reductase (Eurofung)  29.83 
 
 
567 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29811  predicted protein  30.75 
 
 
479 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1256  sterol delta-7-reductase  32.01 
 
 
455 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000127228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1309  putative 7-dehydrocholesterol reductase  32.01 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000135156  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02684  sterol reductase (Eurofung)  28.43 
 
 
488 aa  162  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30461  predicted protein  32.48 
 
 
463 aa  140  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1455  steroid 5-alpha reductase-like  20.54 
 
 
205 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>