14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36016 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_36016  predicted protein  100 
 
 
443 aa  908    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.873623  hitchhiker  0.00561321 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01070  C-14 sterol reductase, putative  44 
 
 
459 aa  354  2e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49215  predicted protein  40.4 
 
 
461 aa  347  2e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.39861 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04094  c-14 sterol reductase (AFU_orthologue; AFUA_1G03150)  39.1 
 
 
496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48260  predicted protein  43.24 
 
 
467 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.113674  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10648  sterol reductase (Eurofung)  29.87 
 
 
567 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1293  delta(24(24(1)))-sterol reductase  28.9 
 
 
459 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1354  putative delta(24(24(1)))-sterol reductase  28.9 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29811  predicted protein  29.09 
 
 
479 aa  166  9e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1256  sterol delta-7-reductase  30.43 
 
 
455 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000127228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1309  putative 7-dehydrocholesterol reductase  30.43 
 
 
455 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000135156  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04470  delta24(24-1) sterol reductase, putative  29.35 
 
 
490 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.322028  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02684  sterol reductase (Eurofung)  28.27 
 
 
488 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30461  predicted protein  29.56 
 
 
463 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>