16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03670 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC03670  hypothetical protein  100 
 
 		 875 aa  1820    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03680  hypothetical protein  48.8 
 
 		 839 aa  754    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10380  Dicer-like protein 2 [Includes Endoribonuclease dcl2(EC 3.1.26.-);ATP-dependent helicase dcl2(EC 3.6.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C5H7]  24.41 
 
 		 1269 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917081  normal  0.453481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  24.23 
 
 		 222 aa  54.7  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  22.22 
 
 		 230 aa  53.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  29.94 
 
 		 226 aa  48.5  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  29.38 
 
 		 246 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  34.35 
 
 		 228 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  27.82 
 
 		 237 aa  47  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  31.93 
 
 		 246 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  26.75 
 
 		 240 aa  45.8  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  31.4 
 
 		 223 aa  45.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0512  Ribonuclease III  21.97 
 
 		 232 aa  45.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  29.94 
 
 		 229 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  23.56 
 
 		 222 aa  44.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  34.11 
 
 		 243 aa  44.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>