10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12398 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12398  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  907    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377693  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0291  hypothetical protein  41.44 
 
 		 449 aa  353  5e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13033  O-antigen polymerase (wzy)  27.67 
 
 		 390 aa  57  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.46 
 
 		 501 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  25.34 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  29.89 
 
 		 754 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  28.8 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0658  O-antigen polymerase family protein  24.47 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.238334  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0270  O-antigen polymerase  26 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.143785  normal  0.425516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  27.5 
 
 		 594 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>