12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09313 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09313  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610659  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.85 
 
 
803 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0337  hypothetical protein  29.87 
 
 
413 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00896127  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  25.54 
 
 
375 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.01 
 
 
504 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  24.13 
 
 
423 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2929  hypothetical protein  24.1 
 
 
395 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  25.74 
 
 
508 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  25 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1609  hypothetical protein  38.98 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.203546  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17211  hypothetical protein  37.29 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17091  hypothetical protein  38.98 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0647106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>