17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0831 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0831  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  60.4 
 
 
322 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  41.67 
 
 
328 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.95 
 
 
328 aa  70.5  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.95 
 
 
328 aa  70.5  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  41.76 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  39.56 
 
 
328 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  41.76 
 
 
328 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  36.26 
 
 
342 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  39.13 
 
 
328 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  39.42 
 
 
329 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  34.44 
 
 
328 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  35.11 
 
 
330 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  35.45 
 
 
326 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 
330 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 
337 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  26.13 
 
 
324 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>