28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0150 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0150  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  332  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1052  hypothetical protein  42.47 
 
 
151 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0039  hypothetical protein  43.26 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0375  hypothetical protein  43.26 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285105  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1209  hypothetical protein  43.26 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7314  hypothetical protein  41.48 
 
 
180 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.0516985 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7580  hypothetical protein  38.24 
 
 
167 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7329  hypothetical protein  36.84 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0104  hypothetical protein  37.86 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6753  hypothetical protein  34.23 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.694812  normal  0.562952 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0635  hypothetical protein  36.3 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6759  hypothetical protein  36.03 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4717  hypothetical protein  36.88 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5555  hypothetical protein  36.88 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5305  hypothetical protein  36.88 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0235  transcriptional regulator, fis family  37.31 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6891  hypothetical protein  37.96 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5426  hypothetical protein  33.57 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4879  hypothetical protein  32.86 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288398  normal  0.359894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3251  hypothetical protein  34.78 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7514  hypothetical protein  34 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0891854  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6576  hypothetical protein  33.87 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143982  hitchhiker  0.00493463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2568  hypothetical protein  32.79 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.756784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4178  hypothetical protein  29.13 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0221  transcriptional regulator, fis family  28.23 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6534  hypothetical protein  29.32 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168837  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6116  hypothetical protein  26.5 
 
 
142 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313869  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7289  hypothetical protein  29 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.000171233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>