22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5305 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5305  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5555  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4717  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  315  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4879  hypothetical protein  93.08 
 
 
159 aa  295  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288398  normal  0.359894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5426  hypothetical protein  89.94 
 
 
159 aa  287  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0104  hypothetical protein  82.35 
 
 
162 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3251  hypothetical protein  77.78 
 
 
162 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0150  hypothetical protein  36.88 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7314  hypothetical protein  37.88 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.0516985 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6759  hypothetical protein  29.22 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7580  hypothetical protein  32 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7329  hypothetical protein  31.65 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737619 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0039  hypothetical protein  30.87 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0375  hypothetical protein  30.87 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285105  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1209  hypothetical protein  30.87 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1052  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353773  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6891  hypothetical protein  33.09 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6753  hypothetical protein  30.83 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.694812  normal  0.562952 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0635  hypothetical protein  30.1 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7514  hypothetical protein  32.04 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0891854  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7289  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.000171233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0235  transcriptional regulator, fis family  27.35 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>