22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4879 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4879  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  315  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288398  normal  0.359894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5426  hypothetical protein  96.86 
 
 		 159 aa  306  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5305  hypothetical protein  93.08 
 
 		 159 aa  295  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5555  hypothetical protein  93.08 
 
 		 159 aa  295  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4717  hypothetical protein  93.08 
 
 		 159 aa  295  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0104  hypothetical protein  83.01 
 
 		 162 aa  253  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3251  hypothetical protein  77.78 
 
 		 162 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0150  hypothetical protein  32.86 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6759  hypothetical protein  30.52 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7314  hypothetical protein  38.64 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.0516985 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7329  hypothetical protein  32.37 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737619 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7580  hypothetical protein  33.85 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0039  hypothetical protein  30.87 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0375  hypothetical protein  30.87 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285105  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1209  hypothetical protein  30.87 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1052  hypothetical protein  30.71 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353773  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6891  hypothetical protein  33.81 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6753  hypothetical protein  32.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.694812  normal  0.562952 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0635  hypothetical protein  30.1 
 
 		 171 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7514  hypothetical protein  31.07 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0891854  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7289  hypothetical protein  29.06 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.000171233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0235  transcriptional regulator, fis family  27.93 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>