25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6759 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6759  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0039  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0375  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285105  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1209  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1052  hypothetical protein  39.31 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353773  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7329  hypothetical protein  42.96 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737619 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7314  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.0516985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0150  hypothetical protein  36.03 
 
 
161 aa  94.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6891  hypothetical protein  34.51 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0104  hypothetical protein  31.65 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4879  hypothetical protein  30.52 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288398  normal  0.359894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5426  hypothetical protein  29.22 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3251  hypothetical protein  32.14 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7580  hypothetical protein  27.81 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4717  hypothetical protein  29.22 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5555  hypothetical protein  29.22 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5305  hypothetical protein  29.22 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0235  transcriptional regulator, fis family  32.58 
 
 
153 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0635  hypothetical protein  32.37 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6753  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.694812  normal  0.562952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6576  hypothetical protein  25 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143982  hitchhiker  0.00493463 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7514  hypothetical protein  26.17 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0891854  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6534  hypothetical protein  26.87 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168837  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6116  hypothetical protein  46.15 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313869  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2568  hypothetical protein  23.73 
 
 
133 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.756784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>