21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6576 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6576  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  309  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143982  hitchhiker  0.00493463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2568  hypothetical protein  87.97 
 
 
133 aa  237  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.756784 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7514  hypothetical protein  56.21 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0891854  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4178  hypothetical protein  53.9 
 
 
154 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0221  transcriptional regulator, fis family  37.68 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0235  transcriptional regulator, fis family  34.56 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6116  hypothetical protein  34.4 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313869  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7580  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0150  hypothetical protein  33.87 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1209  hypothetical protein  35.77 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0375  hypothetical protein  35.77 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0039  hypothetical protein  35.77 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1052  hypothetical protein  35.77 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353773  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7314  hypothetical protein  29.27 
 
 
180 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.0516985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6753  hypothetical protein  30.88 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.694812  normal  0.562952 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6759  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7289  hypothetical protein  25.66 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.000171233 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6534  hypothetical protein  33.04 
 
 
150 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168837  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7108  hypothetical protein  30.3 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0635  hypothetical protein  28.1 
 
 
171 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7329  hypothetical protein  30.53 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>