19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7289 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7289  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  317  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.000171233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7111  hypothetical protein  35.21 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.30263  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3856  hypothetical protein  32.43 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000105532 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0229  hypothetical protein  33.8 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7108  hypothetical protein  31.47 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0235  transcriptional regulator, fis family  29.59 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7514  hypothetical protein  28.1 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0891854  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7580  hypothetical protein  26.09 
 
 
167 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6576  hypothetical protein  25.66 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143982  hitchhiker  0.00493463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0104  hypothetical protein  30.65 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5426  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6534  hypothetical protein  31.68 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168837  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2568  hypothetical protein  26.15 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.756784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0150  hypothetical protein  29 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3251  hypothetical protein  29.84 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4717  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5555  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5305  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289895  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4879  hypothetical protein  29.06 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288398  normal  0.359894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>