31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4033 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  100 
 
 		 369 aa  753    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  71.85 
 
 		 374 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  66.86 
 
 		 360 aa  455  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  62.57 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  62.8 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  62.03 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  60.12 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  60.12 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  53.55 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  55.98 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  53.43 
 
 		 365 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  49.58 
 
 		 379 aa  342  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  51.65 
 
 		 442 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  51.01 
 
 		 384 aa  335  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  49.4 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  43.44 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  45.91 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  43.3 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  46.73 
 
 		 357 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  45.27 
 
 		 353 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  43.28 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  44.64 
 
 		 363 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  43.11 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  45 
 
 		 385 aa  242  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  44.41 
 
 		 375 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  44.01 
 
 		 336 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  39.48 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  37.46 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  28.79 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  26.75 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  30.56 
 
 		 349 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>