31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0043 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  90.96 
 
 		 351 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  74.78 
 
 		 376 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  71.76 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  72.34 
 
 		 363 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  69.91 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  70.52 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  66.57 
 
 		 375 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  68.55 
 
 		 336 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  61.76 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  62.61 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  44.19 
 
 		 384 aa  279  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  42.57 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  42.94 
 
 		 385 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  42.9 
 
 		 365 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  46.92 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  44.94 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  43.16 
 
 		 365 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  42.14 
 
 		 357 aa  252  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  43.32 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  42.74 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  43.07 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  40.16 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  37.69 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  42.82 
 
 		 374 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  42.01 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  40.29 
 
 		 381 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  40.29 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  32.3 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  33.63 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  28.38 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>