31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0108 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  91.32 
 
 		 387 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  721    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  90.76 
 
 		 363 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  80.39 
 
 		 363 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  69.74 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  72.87 
 
 		 351 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  70.73 
 
 		 351 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  67.56 
 
 		 375 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  67.8 
 
 		 336 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  63.72 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  64.13 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  47.25 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  48.04 
 
 		 385 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  46.31 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  46.26 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  46.15 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  48.84 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  45.89 
 
 		 385 aa  268  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  46.9 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  44.81 
 
 		 357 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  41.32 
 
 		 356 aa  242  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  45.16 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  41.48 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  43.24 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  45.35 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  40 
 
 		 442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  41.26 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  40.69 
 
 		 381 aa  208  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  32.7 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  29.19 
 
 		 340 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  34.62 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>