31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2740 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  87.57 
 
 		 384 aa  636    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  100 
 
 		 365 aa  742    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  96.16 
 
 		 365 aa  709    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  65.97 
 
 		 385 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  62.75 
 
 		 379 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  55.92 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  53.55 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  52.21 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  51.71 
 
 		 399 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  50.44 
 
 		 374 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  49.16 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  46.57 
 
 		 363 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  46.59 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  45.14 
 
 		 387 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  47.74 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  47.74 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  46.59 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  45.72 
 
 		 442 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  45.81 
 
 		 363 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  46.06 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  46.61 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  47.89 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  47.35 
 
 		 336 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  44.44 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  42.94 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  43.65 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  43.59 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  36.9 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  31.42 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  27.46 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  30.41 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>