31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0456 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  98.95 
 
 
381 aa  758    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  100 
 
 
381 aa  764    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  68.68 
 
 
399 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  61.49 
 
 
374 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  59.2 
 
 
369 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  60.06 
 
 
384 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  53.95 
 
 
442 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  57.35 
 
 
360 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  53.61 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  49.59 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  50.85 
 
 
357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  47.11 
 
 
365 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  47.46 
 
 
365 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  46.34 
 
 
379 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  46.09 
 
 
385 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  44.07 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  40.5 
 
 
376 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  40.8 
 
 
353 aa  222  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  40.29 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  40.9 
 
 
387 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  39.66 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  37.14 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  40.69 
 
 
357 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  42.15 
 
 
336 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  42.33 
 
 
375 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  38.4 
 
 
363 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  39.26 
 
 
363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  40.06 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  29.72 
 
 
343 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  26.51 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  31.28 
 
 
349 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>