31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3380 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  100 
 
 		 357 aa  719    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  62.64 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  54.24 
 
 		 384 aa  341  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  54.18 
 
 		 369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  55 
 
 		 374 aa  339  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  52.81 
 
 		 360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  56.59 
 
 		 399 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  50.28 
 
 		 379 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  51.88 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  50.56 
 
 		 365 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  48.08 
 
 		 385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  52.27 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  50.85 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  50.85 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  47.45 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  45.38 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  42.66 
 
 		 376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  43.64 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  44.25 
 
 		 363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  43.19 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  44.08 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  44.81 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  42.26 
 
 		 351 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  42.01 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  43.36 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  43.58 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  41.85 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  36.42 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  32 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  31.22 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  25.39 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>