20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1383 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1383  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  201  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1377  hypothetical protein  68.25 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.76 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2519  transposase  75.86 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0829328  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  79.31 
 
 		 338 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  75.86 
 
 		 338 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  75.86 
 
 		 338 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3127  hypothetical protein  79.31 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  68.97 
 
 		 341 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  72.41 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  68.97 
 
 		 338 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  68.97 
 
 		 341 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  68.97 
 
 		 340 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.23 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  65.52 
 
 		 341 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  72 
 
 		 499 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.71 
 
 		 344 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  65.52 
 
 		 341 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0804  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  62.07 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796908  hitchhiker  0.00222246 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.71 
 
 		 346 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>