15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0009 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0009  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0263  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617224  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  85.54 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0035  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.641797  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0405  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00881766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0054  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 88 bp  60  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000280744  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0048  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0002  tRNA-Tyr  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0056  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000675719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  88.37 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0437  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000091753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>