26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0054 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0054  tRNA-Tyr  100 
 
 
88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000280744  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0048  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0002  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  81.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  97.67 
 
 
86 bp  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  97.67 
 
 
86 bp  77.8  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  97.5 
 
 
86 bp  71.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0056  tRNA-Tyr  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000675719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0022  tRNA-Tyr  94.87 
 
 
84 bp  61.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4432900000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0009  tRNA-Tyr  92.86 
 
 
83 bp  60  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0029  tRNA-Tyr  86.76 
 
 
84 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000326134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0028  tRNA-Tyr  92.5 
 
 
86 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000249872  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_871  tRNA-Tyr  86.76 
 
 
84 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000164739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0048  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
84 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0033  tRNA-Tyr  94.44 
 
 
84 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000103069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  86.76 
 
 
84 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000899058  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0023  tRNA-Tyr  92.31 
 
 
86 bp  54  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0238179  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0405  tRNA-Tyr  92.31 
 
 
83 bp  54  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00881766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0035  tRNA-Tyr  92.31 
 
 
83 bp  54  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.641797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0037  tRNA-Tyr  92.11 
 
 
86 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.499961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  90.24 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  90.24 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  91.67 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0263  tRNA-Tyr  89.74 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0058  tRNA-Tyr  89.47 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>