51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0263 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0263  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000617224  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0056  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000675719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0009  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0405  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 83 bp  67.9  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00881766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  87.3 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  87.32 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0035  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 83 bp  60  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.641797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0031  tRNA-Tyr  85.92 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.219663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0015  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0035  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  87.72 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  85.96 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  85.96 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0437  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000091753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0054  tRNA-Tyr  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000280744  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1123t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1111t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.797073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1109t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.060013  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1106t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3159t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3157t  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0048  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.323881 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna128  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000522671  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna127  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000596133  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna126  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna049  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000729989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0002  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0048  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0033  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000103069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0436  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3207t  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0563071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3169t  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0000963537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3168t  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3167t  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000658084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>