91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_R0001 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_R0001  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0872733  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1591  tRNA-Cys  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0177863  normal  0.766163 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000388055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0069  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0038  tRNA-Cys  88.89 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123797  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0650273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5684  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0257731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0613  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000112744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000664876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5719  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00287559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4764  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0538  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.435960000000001e-32 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0128228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0459686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0091  tRNA-Cys  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0052  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0040  tRNA-Cys  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0019  tRNA-Cys  88 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0037  tRNA-Cys  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.21352e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11970  tRNA-Cys  86.54 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000107852  normal  0.103801 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt026  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0016  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0013  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201212  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0069  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476746  normal  0.206288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0022  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0001  tRNA-Cys  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.364901  hitchhiker  0.00165613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0064  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0020  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.979137  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0077  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0037  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0074  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326244  normal  0.181678 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0004  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0027  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0008  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0037  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0029  tRNA-Cys  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000761826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0048  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.807187  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0030  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512325  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0024  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0011  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0047  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0011  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.606624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0065  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000051222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0008  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.825941  normal  0.0317691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0009  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0002  tRNA-Cys  85.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150631  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0026  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000374248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0012  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2454  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1864  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2769  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2153  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0032  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0022  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000266732  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0047  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0010  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0018  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0011  tRNA-Cys  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.23607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>