24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_R0011 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_R0011  tRNA-Cys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.606624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0010  tRNA-Cys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0011  tRNA-Cys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.23607  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0009  tRNA-Cys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  90.74 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0042  tRNA-Cys  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.815028  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0052  tRNA-Cys  88.68 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1591  tRNA-Cys  96.88 
 
 
71 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0177863  normal  0.766163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0030  tRNA-Cys  87.27 
 
 
72 bp  54  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.512325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  87.04 
 
 
75 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0038  tRNA-Cys  85.96 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123797  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0031  tRNA-Cys  86.79 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  85.96 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000388055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0037  tRNA-Cys  91.67 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.21352e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0050  tRNA-Cys  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000040729  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0065  tRNA-Cys  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0045  tRNA-Cys  86.27 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.364336  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0028  tRNA-Cys  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0001  tRNA-Cys  91.18 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0872733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>