27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1729 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1729  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  630  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0843802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  20.25 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  19.33 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  18.71 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  23.58 
 
 
584 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  22.01 
 
 
341 aa  56.2  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  20.45 
 
 
324 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.12 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  20.89 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  21.31 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  20.81 
 
 
343 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  18.52 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  20.49 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  20.12 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  16.88 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  19.64 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  19.79 
 
 
349 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  20 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  21.79 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.66 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  20 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  19.35 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  20.31 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  18.84 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  20.98 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  18.06 
 
 
326 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  23.25 
 
 
298 aa  42.7  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>