13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2618 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2618    100 
 
 		 760 bp  1507    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.330314  normal  0.98253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  81.19 
 
 		 861 bp  157  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5539  transposase  82.74 
 
 		 612 bp  121  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.0199842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  81.82 
 
 		 861 bp  105  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1456  integrase catalytic region  85.32 
 
 		 714 bp  89.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0392097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  90 
 
 		 843 bp  60  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  90 
 
 		 843 bp  60  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1861  hypothetical protein  83.75 
 
 		 336 bp  56  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5454    83.13 
 
 		 285 bp  54  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5541    83.13 
 
 		 285 bp  54  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.265794  normal  0.0182876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  90 
 
 		 891 bp  48.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  90 
 
 		 891 bp  48.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2017    85.71 
 
 		 546 bp  48.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>