30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0500 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  248  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3119  hypothetical protein  47.66 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4862  hypothetical protein  37.19 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2173  hypothetical protein  42.57 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136138  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3881  hypothetical protein  41.12 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3489  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3333  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.919209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1543  putative lipoprotein  34.21 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4714  hypothetical protein  35.59 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6132  hypothetical protein  40.95 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0428832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1947  hypothetical protein  40.95 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00296399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1971  hypothetical protein  40.95 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0447204  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5258  hypothetical protein  40.59 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000511759  normal  0.636992 
 
 
 
NC_009074  BURPS668_2366  hypothetical protein  42.16 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1496  hypothetical protein  42.16 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2408  hypothetical protein  42.16 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3315  hypothetical protein  42.16 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0170316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1993  hypothetical protein  42.16 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2516  hypothetical protein  42.16 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1324  hypothetical protein  41.75 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587012  hitchhiker  0.00108007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1151  hypothetical protein  39.52 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3094  lipoprotein, putative  39.05 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04864  lipoprotein, putative  34.92 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3298  hypothetical protein  46.25 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0765375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2084  hypothetical protein  42.16 
 
 		 191 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2344  putative lipoprotein  36.79 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3151  putative secreted protein  36 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0749473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2524  hypothetical protein  36.46 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0621  hypothetical protein  29.41 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0347929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4270  hypothetical protein  32.98 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>