23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4270 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4270  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2524  hypothetical protein  35.51 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0899957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1543  putative lipoprotein  28.46 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1151  hypothetical protein  34.55 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3333  putative lipoprotein  32.67 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.919209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3489  putative lipoprotein  31.68 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4714  hypothetical protein  30.89 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4862  hypothetical protein  26.73 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3151  putative secreted protein  32.11 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0749473  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3094  lipoprotein, putative  28.18 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0500  hypothetical protein  32.98 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547819  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2344  putative lipoprotein  28.04 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0621  hypothetical protein  26.77 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0347929  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5258  hypothetical protein  30.33 
 
 
176 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000511759  normal  0.636992 
 
 
 
NC_008542  Bcen2424_1947  hypothetical protein  30.36 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00296399  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6132  hypothetical protein  30.36 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0428832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04864  lipoprotein, putative  33.71 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1971  hypothetical protein  30.36 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0447204  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3298  hypothetical protein  37.78 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0765375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3119  hypothetical protein  32.81 
 
 
165 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.822471  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1324  hypothetical protein  31.43 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587012  hitchhiker  0.00108007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3881  hypothetical protein  31.31 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2173  hypothetical protein  30.51 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136138  normal  0.0180917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>