30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3489 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3489  putative lipoprotein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3333  putative lipoprotein  91.03 
 
 		 146 aa  242  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.919209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4862  hypothetical protein  63.36 
 
 		 144 aa  178  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1543  putative lipoprotein  60 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3151  putative secreted protein  40.25 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0749473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4714  hypothetical protein  40.14 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0500  hypothetical protein  38.71 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3298  hypothetical protein  40.15 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0765375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2344  putative lipoprotein  36.96 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04864  lipoprotein, putative  41.44 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3119  hypothetical protein  36.81 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2366  hypothetical protein  33.97 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456188  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2408  hypothetical protein  33.97 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2516  hypothetical protein  33.97 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3094  lipoprotein, putative  35.21 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5258  hypothetical protein  36.18 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000511759  normal  0.636992 
 
 
 
NC_006348  BMA1496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0170316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1971  hypothetical protein  36 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0447204  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1947  hypothetical protein  36.59 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00296399  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6132  hypothetical protein  36.59 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0428832  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3881  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2524  hypothetical protein  36.63 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899957 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2084  hypothetical protein  31.17 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2173  hypothetical protein  32.33 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136138  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1324  hypothetical protein  34.35 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587012  hitchhiker  0.00108007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1151  hypothetical protein  37.76 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4270  hypothetical protein  31.68 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0621  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0347929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>