31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3119 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3881  hypothetical protein  62.6 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2173  hypothetical protein  56.91 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136138  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6132  hypothetical protein  50.86 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0428832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1947  hypothetical protein  50.86 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00296399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1971  hypothetical protein  50.86 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0447204  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5258  hypothetical protein  44.37 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000511759  normal  0.636992 
 
 
 
NC_010338  Caul_4714  hypothetical protein  47.58 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2366  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456188  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2516  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2408  hypothetical protein  43.75 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1496  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3315  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0170316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1993  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648203  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1324  hypothetical protein  46.22 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587012  hitchhiker  0.00108007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2084  hypothetical protein  41.61 
 
 		 191 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304336  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0500  hypothetical protein  47.66 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3298  hypothetical protein  39.26 
 
 		 141 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0765375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3151  putative secreted protein  39.16 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0749473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0621  hypothetical protein  35.65 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0347929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1543  putative lipoprotein  34.56 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1151  hypothetical protein  45.36 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2524  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4862  hypothetical protein  38.68 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3333  putative lipoprotein  36.92 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.919209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3489  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04864  lipoprotein, putative  36.43 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3094  lipoprotein, putative  38.21 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2344  putative lipoprotein  34.06 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4270  hypothetical protein  32.81 
 
 		 129 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2132  hypothetical protein  37.25 
 
 		 113 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.351388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>