30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2344 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2344  putative lipoprotein  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3094  lipoprotein, putative  67.32 
 
 		 153 aa  203  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3151  putative secreted protein  48.77 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0749473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04864  lipoprotein, putative  55.81 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1543  putative lipoprotein  37.16 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4862  hypothetical protein  37.06 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3333  putative lipoprotein  42.45 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.919209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3489  putative lipoprotein  40.57 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2524  hypothetical protein  41.03 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3119  hypothetical protein  33.78 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.822471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0500  hypothetical protein  36.79 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0621  hypothetical protein  32.11 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0347929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4714  hypothetical protein  31.47 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2173  hypothetical protein  36.15 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136138  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1971  hypothetical protein  32.28 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0447204  normal  0.041626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3298  hypothetical protein  41.67 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0765375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3881  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1947  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00296399  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6132  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0428832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1324  hypothetical protein  33.07 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587012  hitchhiker  0.00108007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5258  hypothetical protein  32.31 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000511759  normal  0.636992 
 
 
 
NC_009720  Xaut_1151  hypothetical protein  31.53 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4270  hypothetical protein  28.04 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2408  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2516  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2366  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1496  hypothetical protein  32.31 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0639522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3315  hypothetical protein  32.31 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0170316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1993  hypothetical protein  32.31 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2084  hypothetical protein  30.23 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>