21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0166 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2198  hypothetical protein  49.03 
 
 
934 aa  831    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57836  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3114  hypothetical protein  49.62 
 
 
933 aa  851    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0166  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 
930 aa  1909    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4874  zinc finger CHC2-family protein  93.63 
 
 
931 aa  1776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0337789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0967  hypothetical protein  50.27 
 
 
933 aa  869    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3307  zinc finger, CHC2-type  27.65 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112325  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  28.03 
 
 
588 aa  49.3  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  27.56 
 
 
646 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  27.56 
 
 
646 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  31.51 
 
 
647 aa  48.5  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  28.92 
 
 
639 aa  47.8  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  28.72 
 
 
603 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  28.72 
 
 
603 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  27.34 
 
 
640 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  30.2 
 
 
625 aa  46.2  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0861  DNA primase  28.57 
 
 
609 aa  46.2  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  27.33 
 
 
655 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  23.18 
 
 
546 aa  45.8  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  33.62 
 
 
945 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  29.49 
 
 
583 aa  45.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  24.88 
 
 
601 aa  44.3  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>