25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4874 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2198  hypothetical protein  49.68 
 
 
934 aa  832    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0967  hypothetical protein  50.48 
 
 
933 aa  865    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3114  hypothetical protein  49.73 
 
 
933 aa  852    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0166  zinc finger CHC2-family protein  93.63 
 
 
930 aa  1754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4874  zinc finger CHC2-family protein  100 
 
 
931 aa  1911    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0337789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3307  zinc finger, CHC2-type  27.01 
 
 
389 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112325  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  25.78 
 
 
945 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  28.95 
 
 
407 aa  49.3  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  23.42 
 
 
554 aa  48.5  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  30.82 
 
 
647 aa  48.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  28.31 
 
 
639 aa  48.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  27.81 
 
 
588 aa  48.1  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0861  DNA primase  27.7 
 
 
609 aa  47.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  28.57 
 
 
603 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  32.53 
 
 
704 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  28.57 
 
 
603 aa  47  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4800  zinc finger, CHC2-family protein  28.24 
 
 
2510 aa  46.6  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0650684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  30.2 
 
 
625 aa  47  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  25.73 
 
 
633 aa  46.2  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  29.59 
 
 
625 aa  45.8  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  26.62 
 
 
655 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  25.98 
 
 
646 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  25.98 
 
 
646 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  29.58 
 
 
685 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  25.96 
 
 
675 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>