13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3936 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3936  hypothetical protein  100 
 
 		 1340 aa  2695    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3592  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1136 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0789329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3589  hypothetical protein  24.46 
 
 		 924 aa  181  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.368202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3540  hypothetical protein  24.69 
 
 		 855 aa  84  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179214  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2415  hypothetical protein  25.56 
 
 		 857 aa  72.4  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3593  hypothetical protein  21.43 
 
 		 859 aa  68.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2607  hypothetical protein  26.14 
 
 		 864 aa  65.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  33.68 
 
 		 717 aa  56.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2774  peptidase M23B  37.5 
 
 		 571 aa  52  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1123 aa  52  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3112  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.13 
 
 		 496 aa  49.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7871  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.06 
 
 		 508 aa  49.3  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  31.88 
 
 		 676 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>