13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3278 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3278  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  346  9e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191166  hitchhiker  0.00385332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2252  putative serine protease  31.82 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000202856 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  29.21 
 
 
478 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1951  putative kinase  23.03 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5490  hypothetical protein  32.89 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2247  putative kinase  24.26 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  34.4 
 
 
533 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  28.99 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  30.47 
 
 
490 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  52.63 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  43.4 
 
 
533 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  57.89 
 
 
169 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  39.06 
 
 
190 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>