18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6525 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6525  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5593  hypothetical protein  88.02 
 
 		 242 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6237  hypothetical protein  59.83 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5242  hypothetical protein  55.42 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1601  hypothetical protein  55.42 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3824  hypothetical protein  41.92 
 
 		 243 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0937029  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1595  hypothetical protein  43.97 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.691344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2538  hypothetical protein  42.04 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5024  hypothetical protein  32.92 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1659  hypothetical protein  35.71 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5193  hypothetical protein  34.32 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5066  hypothetical protein  29.74 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4296  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.337825 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5507  hypothetical protein  31.08 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.467204 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4407  hypothetical protein  27.16 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2985  hypothetical protein  32.74 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4312  hypothetical protein  27.67 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3233  hypothetical protein  30.58 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>