18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5066 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5066  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  544  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4296  hypothetical protein  45.49 
 
 
265 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.337825 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5024  hypothetical protein  32.71 
 
 
247 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541347  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1595  hypothetical protein  33.99 
 
 
246 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.691344  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6237  hypothetical protein  31.44 
 
 
239 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2538  hypothetical protein  33.78 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5593  hypothetical protein  30.17 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1601  hypothetical protein  29.26 
 
 
240 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157654  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5242  hypothetical protein  29.26 
 
 
240 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3824  hypothetical protein  28.69 
 
 
243 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0937029  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6525  hypothetical protein  29.74 
 
 
242 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1659  hypothetical protein  29.61 
 
 
240 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4407  hypothetical protein  29.65 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5193  hypothetical protein  28.76 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2985  hypothetical protein  28.64 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4312  hypothetical protein  26.38 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3233  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252568  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5507  hypothetical protein  29.05 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.467204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>