18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3233 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3233  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  511  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252568  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2985  hypothetical protein  38.43 
 
 
242 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5066  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5024  hypothetical protein  31.17 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541347  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4407  hypothetical protein  33.77 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4296  hypothetical protein  36.7 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.337825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1659  hypothetical protein  30.53 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6237  hypothetical protein  29.52 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1595  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  62  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.691344  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5593  hypothetical protein  28.92 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5507  hypothetical protein  25.1 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.467204 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6525  hypothetical protein  30.58 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2538  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1601  hypothetical protein  28 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157654  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5242  hypothetical protein  28 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3824  hypothetical protein  28.65 
 
 
243 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0937029  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5193  hypothetical protein  31.43 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0538  hypothetical protein  26.44 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>